سالها پس از جلوگیری از روز داوری، جان کانر به شکل ناشناس و دور از شبکههای رسمی زندگی میکند تا ماشینها نتوانند ردش را پیدا کنند. اما اسکاینت هنوز در آینده شکل گرفته و این بار ترمیناتوری پیشرفته به نام T-X را به گذشته میفرستد. مأموریت او فقط کشتن جان نیست؛ اعضایی که قرار است بعدها هسته مقاومت انسانی را تشکیل دهند نیز در فهرست اهداف قرار دارند. یکی از آنها کیت بروستر است که برخورد دوبارهاش با جان، هر دو را وارد فراری ناخواسته میکند. مقاومت برای حفاظت از آنها یک T-850 بازبرنامهریزیشده میفرستد. این ترمیناتور خبر مهمی دارد: رویدادی که تصور میشد لغو شده، فقط به تأخیر افتاده است. «Terminator 3: Rise of the Machines» تعقیب همیشگی انسان و ماشین را با تلاش برای درک یک آینده اجتنابناپذیر ترکیب میکند. جان و کیت باید علاوه بر فرار از T-X، بفهمند چرا هر دو برای مقاومت آینده اهمیت دارند و آیا هنوز راهی برای جلوگیری از فعال شدن سامانهای وجود دارد که قرار است جهان را تغییر دهد.