سوء استفاده های فاکس مولدر و دانا اسکالی ماموران ویژه FBI که به بررسی فایل های ایکس می پردازند: پرونده های به حاشیه رانده شده و حل نشده مربوط به پدیده های ماوراء الطبیعه. مولدر به وجود بیگانگان و ماوراء الطبیعه اعتقاد دارد، در حالی که اسکالی، یک شکاک، مأمور می شود تا تحلیل های علمی اکتشافات مولدر انجام دهد که کار مولدر را بی اعتبار می کند و بنابراین او را به پرونده های اصلی باز می گرداند.