U.N.G.C.C. (مرکز مقابله با گودزیلا سازمان ملل) بقایای مچا-شاه گیدورا را بازیابی می کند و مکاگودزیلا را به عنوان یک اقدام متقابل علیه گودزیلا می سازد. در همین حین، یک تخم غول پیکر همراه با هیولای جدیدی به نام رودان کشف می شود. به زودی مشخص می شود که تخم مرغ چیزی نیست جز یک گودزیلازاروس نوزاد.