«پروتئین» ترکیبی از جنایت و وحشت سیاه است که با قاتلی زنجیره‌ای و وسواس شدید او نسبت به بدن و ورزش آغاز می‌شود. مرد اصلی ساعت‌های زیادی در باشگاه می‌گذراند و منطق بیمارگونه‌ای برای رژیم خود دارد: او قربانیانش را به عنوان منبع «پروتئین» می‌بیند. وقتی یکی از فروشندگان مواد مخدر محلی را می‌کشد و می‌خورد، بدون آنکه قصدش را داشته باشد تعادل میان گروه‌های خلافکار منطقه را برهم می‌زند. ناپدید شدن مرد به حساب باند رقیب گذاشته می‌شود و سوءظن به سرعت به درگیری خونین و جنگ قلمرو تبدیل می‌گردد. در حالی که گروه‌ها یکدیگر را مسئول می‌دانند، پلیس نیز با مجموعه‌ای از نشانه‌های عجیب روبه‌رو می‌شود و قاتل تلاش می‌کند برنامه شخصی خودش را ادامه دهد. فیلم از فاصله میان انگیزه واقعی قتل و برداشتی که مجرمان از آن دارند طنزی بسیار تاریک می‌سازد. خشونت باندی و وسواس بدنی دو خط داستانی هستند که به‌تدریج به هم نزدیک می‌شوند و هر قتل، آشوبی بزرگ‌تر از قصد اولیه ایجاد می‌کند.