کنشین با درخواستی از دولت میجی به زندگی جدید خود با کائورو و سایر دوستانش وارد شده است. ماکوتو شیشیو، یک قاتل سابق مانند کنشین، مورد خیانت قرار گرفت، به آتش کشیده شد و مرده رها شد. او جان سالم به در برد و اکنون در کیوتو است و با رزمندگان جمع شده خود برای سرنگونی دولت جدید نقشه می کشد. بر خلاف میل کائورو، کنشین با اکراه موافقت می کند که به کیوتو برود و به جلوگیری از سقوط کشورش به جنگ داخلی کمک کند.