دو سال پس از آنکه اختلاف‌های درونی باعث فروپاشی گروه Mystery Inc. شده، فرد، دافنه، ولما، شگی و اسکوبی هرکدام جداگانه زندگی می‌کنند. دعوت امیل مونداریوس، مالک تفریحگاه مشهور Spooky Island، دوباره آن‌ها را در یک سفر مشترک کنار هم می‌آورد؛ هرچند هیچ‌کدام هنوز از دلخوری‌های قدیمی عبور نکرده‌اند. مهمانان جوان جزیره پس از مدتی رفتاری عجیب و بی‌احساس پیدا می‌کنند و کارکنان مجموعه توضیح قانع‌کننده‌ای برای این تغییر ندارند. اعضای گروه ناچار می‌شوند دوباره همان مهارت‌های قدیمی را کنار هم بگذارند: ولما سرنخ‌ها را تحلیل می‌کند، فرد به طراحی نقشه‌ها می‌پردازد، دافنه تلاش می‌کند ثابت کند فقط عضو آسیب‌پذیر گروه نیست و شگی و اسکوبی ناخواسته وارد خطرناک‌ترین موقعیت‌ها می‌شوند. پرونده جدید به رازهایی درباره موجودات ناشناس، آیین‌های عجیب و گذشته خود Mystery Inc. پیوند می‌خورد و آزمونی برای دوستی گروه است. طنز فیلم نیز بیشتر از ترس همیشگی شگی و اسکوبی و رابطه صمیمی آن دو شکل می‌گیرد.