مدتی پس از شکست سازمان گورگوم، کوتارو مینامی تلاش می‌کند زندگی عادی تازه‌ای بسازد و به عنوان خلبان هلیکوپتر کار می‌کند. آرامش او با ظهور امپراتوری بحران پایان می‌یابد؛ نیرویی بیگانه که قصد تسلط بر زمین را دارد. کوتارو ربوده می‌شود و فرماندهان دشمن از او می‌خواهند به آن‌ها بپیوندد، اما وقتی مخالفت می‌کند سنگ پادشاهی او را نابود کرده و به فضا پرتابش می‌کنند. تابش خورشید به شکلی غیرمنتظره قدرتش را دگرگون می‌کند و او با هویت تازه «کامن رایدر بلک RX» بازمی‌گردد. از آن پس نبردش با نیروهای بحران شکل اصلی مجموعه را می‌سازد. او علاوه بر قدرت‌های جدید، در طول داستان شکل‌ها و ابزارهای تازه‌ای به دست می‌آورد و برای محافظت از خانواده ساهارا و مردم عادی می‌جنگد. سریال در عین ادامه مستقیم «کامن رایدر بلک»، دشمنی تازه و مقیاسی بزرگ‌تر معرفی می‌کند و کوتارو را میان آرزوی زندگی معمولی و مسئولیتی که قدرتش بر دوشش گذاشته نگه می‌دارد.
