زندگی شینوبی ها در حال تغییر است. بوروتو اوزوماکی، پسر هفتمین هوکاگه ناروتو اوزوماکی، در آکادمی نینجا ثبت نام کرده است تا راه های نینجا را بیاموزد. اکنون، با رخ دادن یک سری رویدادهای مرموز، داستان بوروتو در شرف شروع است!