وقایع این انیمیشن در حاشیه یک اسکله بزرگ رخ می‌دهد، جایی که کارآگاه کونان باید با یک توطئه خطرناک دست و پنجه نرم کند. در این سفر پرهیجان، شخصیت‌ها با چالش‌های جدی مواجه شده و رمز و رازهای تیره‌ای را کشف می‌کنند.