شش نوجوان زیر نظر یک استاد کهنه‌کار تمرین می‌کنند و یک شبه به نینجاهای قهرمان تبدیل می‌شوند. آن‌ها با هیولاها می‌جنگند، سوار خودروها می‌شوند و سرزمین نینجاگو را از دست اژدها نجات می‌دهند. در این داستان جنگ‌سالار لرد گارمادون با این واقعیت روبرو است که یکی از شش نوجوان پسر او است و باید با این موضوع را قبول کند.