لاک‌پشت‌های نینجا پس از شکست شردر هنوز باید از شهر نیویورک محافظت کنند. کشف ماده جهش‌زایی که در گذشته باعث شکل‌گیری خودشان شده، توجه شردر زنده‌مانده را جلب می‌کند و او با استفاده از آن دو موجود جهش‌یافته خطرناک، توکا و راهزار، می‌سازد. لئوناردو، رافائل، دوناتلو و مایکل‌آنجلو در کنار اسپلینتر و دوستانشان باید هم جلوی دشمن قدیمی را بگیرند و هم حقیقت بیشتری درباره منشأ خود کشف کنند. در «لاک پشت های نینجا : کشف راز اوز»، جزئیات تازه از دل همان مسئله اصلی بیرون می‌آیند و «Teenage Mutant Ninja Turtles II: The Secret of the Ooze» از حاشیه‌روی یا توضیح‌های بیرون از داستان دور می‌ماند. ساختار داستان «لاک پشت های نینجا : کشف راز اوز» داده‌های روایی را مرحله‌ای آشکار می‌کند و «Teenage Mutant Ninja Turtles II: The Secret of the Ooze» تا فرجام، نتیجه تنش مرکزی را به‌جای توضیح زودهنگام باز نگه می‌دارد. «لاک پشت های نینجا : کشف راز اوز» با حفظ پیچش‌های فرجامی، زمینه را کامل می‌کند؛ «Teenage Mutant Ninja Turtles II: The Secret of the Ooze» خواسته قهرمان‌های ساختار داستان، مهم‌ترین مانع و دگرگونی روابطشان را محور قرار می‌دهد.