در «Transformers: Armada» نبرد قدیمی اتوباتها و دیسپتیکانها زمانی وارد مرحلهای تازه میشود که گروهی از نوجوانان روی زمین با رباتهای کوچکی به نام مینیکانها روبهرو میشوند. این موجودات میتوانند با ترنسفورمرهای بزرگتر ترکیب شوند و قدرت آنها را به شکل چشمگیری افزایش دهند، بنابراین هر دو جناح میخواهند پیش از دیگری مینیکانهای پراکنده روی زمین را پیدا کنند. آپتیموس پرایم و اتوباتها تلاش میکنند از آزادی آنها محافظت کنند، در حالی که مگاترون میخواهد از قدرتشان برای پیروزی نهایی استفاده کند. انسانهای جوان به متحدان اتوباتها تبدیل میشوند و ماجرا از شهرهای زمینی به نبردهایی در مقیاس فضایی گسترش پیدا میکند. سریال علاوه بر اکشن رباتی، روی انتخاب خود مینیکانها و این پرسش تمرکز دارد که آیا آنها ابزار جنگ هستند یا موجوداتی با اراده مستقل. رقابت برای جمعآوری آنها خط اصلی فصلها را شکل میدهد و به تدریج گذشته این جنگ و تهدیدهای بزرگتری را آشکار میکند.