در این انیمه، کارآگاه کونان به پایتخت باستانی سفر می‌کند تا در معمایی پیچیده و مرموز شرکت کند. در این مسیر، او با چالش‌های جدید و دشمنانی غافلگیرکننده روبه‌رو می‌شود که همگی در تلاش برای حل معما و کشف حقیقت هستند.