ریکو، رگ و ناناچی پس از عبور از لایه‌های خطرناک ابیس به «ایدوفِرنت» در لایه پنجم می‌رسند؛ ایستگاهی که برای ادامه سفر به عمق بیشتر باید از آن عبور کنند. آنجا با باندروود، یکی از وایت ویسل‌های مشهور و پژوهشگری روبه‌رو می‌شوند که ناناچی از گذشته روش‌های بی‌رحمانه‌اش را می‌شناسد. دختر جوانی به نام پروشکا نیز در این پایگاه زندگی می‌کند و با وجود فضای سرد و آزمایشگاهی محیط، به سرعت با گروه ارتباط می‌گیرد. مشکل این است که مجوز عبور به لایه ششم و رازهای فناوری باندروود به تحقیقاتی گره خورده که مرز اخلاق را مدت‌هاست پشت سر گذاشته‌اند. «Made in Abyss: Dawn of the Deep Soul» مستقیماً ادامه سفر فصل نخست انیمه است و بدون شناخت رابطه ریکو، رگ و ناناچی بخش زیادی از بار عاطفی آن از دست می‌رود. سه شخصیت اصلی می‌دانند بالا رفتن از ابیس تقریباً ناممکن است، بنابراین برای ادامه مسیر باید از همین ایستگاه عبور کنند. مواجهه با باندروود آزمونی است که نه فقط قدرت رگ، بلکه اعتماد گروه و تعریفشان از انسانیت را در برابر منطق سرد یک پژوهشگر قرار می‌دهد.