یک سال پس از مرگ دوست و شریک زندگی‌اش شرلوک هلمز به دست موریارتی، دکتر جان واتسون حرفه پزشکی خود را به عنوان رئیس کلینیکی که به درمان اختلالات نادر اختصاص داده شده بود، از سر گرفت. با این حال، او به زودی متوجه می شود که زندگی قدیمی اش هنوز با او تمام نشده است.