کوزکو پس از تجربه تبدیل شدن به لاما باید برای رسیدن دوباره به تاج‌وتخت، دوره تحصیل در آکادمی را بگذراند. ایزما و کرانک همچنان نقشه می‌کشند او شکست بخورد و فرصت‌های کمدی زیادی ایجاد می‌کنند. کوزکو در هر قسمت با خودخواهی، مسئولیت و دوستی روبه‌رو می‌شود و مالینا و پچا نیز در ماجراها حضور دارند. مجموعه طنز فیلم اصلی را در قالب داستان‌های مدرسه‌ای ادامه می‌دهد. در «مدرسه جدید امپراتور»، جزئیات تازه از دل همان مسئله اصلی بیرون می‌آیند و «The Emperor's New School» از حاشیه‌روی یا توضیح‌های بیرون از داستان دور می‌ماند. هسته «The Emperor's New School» روی علت و نتیجه انتخاب‌های مهمست؛ «مدرسه جدید امپراتور» اجازه می‌دهد مخاطب جهان و کشمکش را بشناسد بی‌آنکه بخش پایانی از پیش روشن شود. قصه «مدرسه جدید امپراتور» جزئیات را مرحله‌ای روشن می‌کند و «The Emperor's New School» تا بخش پایانی، نتیجه کشمکش را به‌جای توضیح زودهنگام باز نگه می‌دارد. در «مدرسه جدید امپراتور»، تمرکز اصلی روی پیامد انتخاب‌ها باقی می‌ماند و «The Emperor's New School» روابط آدم‌های داستان را هم‌زمان با چالش اصلی پیش می‌برد.