اسکوبیدو و شگی این بار با مسئلهای بزرگتر از یک معمای معمولی روبهرو میشوند. پس از آنکه سیزده روح خطرناک از صندوقی جادویی آزاد میشوند، آنها همراه دافنه، اسکرپیدو و پسری جوان به نام فلیمفلم راهی مجموعهای از ماجراجوییهای فراطبیعی میشوند تا ارواح را یکییکی پیدا کرده و دوباره زندانی کنند. راهنمای گروه وینسنت ونگول، جادوگری آگاه به جهان ارواح است که درباره تهدیدهای هر پرونده هشدار میدهد. برخلاف بسیاری از داستانهای کلاسیک اسکوبیدو، خطرها در این مجموعه معمولاً فقط آدمهایی با لباس مبدل نیستند و عناصر جادویی واقعاً بخشی از جهان سریالاند. شگی و اسکوبی همان ترس همیشگی را دارند، اما اغلب درست در لحظهای که همه چیز خراب میشود نقش مهمی در نجات گروه پیدا میکنند. هر قسمت مأموریتی تازه برای یافتن یکی از موجودات آزادشده دارد و در کنار طنز و تعقیبوگریز، خط اصلی مجموعه تلاش برای بازگرداندن تمام سیزده روح به صندوق و جلوگیری از آسیب بیشتر آنهاست.